企業生產經營是一個連續的過程，而電子手冊以企業產品為單元管理，而且有效期為半年或一年，無論在產品和時間上都是割裂的，無法與生產經營匹配。在電子手冊之間，特別是新舊手冊交替時，最容易出現手冊串料的問題。而且手冊進出口都有詳細的時間記錄，在稽查或核查中很容易就被海關查獲。
蘇州海關對某科技公司稽查時發現，該公司2019年和2021年各申請了一本電子手冊。2019年的電子手冊已經在2021年3月末核銷結案，2021年的電子手冊在稽查時仍然在執行中。2021年電子手冊初次出口時（2021年3月初），使用的是2019年電子手冊的剩余料件。而2019年的電子手冊在2021年3月末才完成轉料手續。根據海關相關法規，企業構成了違反海關監管規定的程序性違規（說白了就是要完成轉料后，才能使用這些剩余料件來生產），也因此受到處罰。
拋開上述海關監管規定程序是否合理的爭議，該企業真的就做錯了嗎？這也未必，首先，按電子手冊的管理方法，對于同一種產品，企業很難做到區分手冊出口，因為從數據上，產品外觀上都沒有標識產品屬于a手冊還是b手冊。退一萬步說，以上述案例來說，就算企業知道了該用2019年的手冊出口，但此時手冊有效期已過，正在核銷中，如果轉料后再出口就要延遲出口時間，除非使用2021年的手冊出口。面臨這個選擇，100%的企業都會選擇后者吧。
所以還是那句話，加工貿易企業最好采用電子賬冊，以企業為單元管理，一本賬冊，沒有有效期只有周轉期，這樣更符合企業的生產經營要求。
參考：海關法
第三十二條 經營保稅貨物的儲存、加工、裝配、展示、運輸、寄售業務和經營免稅商店，應當符合海關監管要求，經海關批準，并辦理注冊手續。
保稅貨物的轉讓、轉移以及進出保稅場所，應當向海關辦理有關手續，接受海關監管和查驗。
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